解析

(1)应当撤销假释。《中华人民共和国刑法》第八十六条第一款规定：“被假释的犯罪分子，在假释考验期限内犯新罪，应当撤销假释，依照本法第七十一条的规定实行数罪并罚。”本题中，甲在假释考验期的第二年又犯强奸罪，虽然是在假释考验期满后才被发现，但也应当撤销假释，依照《中华人民共和国刑法》第七十一条规定的先减后并的方法实行并罚。 (2)成立累犯。《中华人民共和国刑法》第六十五条规定：“被判处有期徒刑以上刑罚的犯罪分子，刑罚执行完毕或者赦免以后，在五年以内再犯应当判处有期徒刑以上刑罚之罪的，是累犯，应当从重处罚，但是过失犯罪和不满十八周岁的人犯罪的除外。前款规定的期限，对于被假释的犯罪分子，从假释期满之日起计算。”甲在假释考验期满后的第三年盗窃他人汽车，属于五年以内再犯应当判处有期徒刑以上刑罚之罪，成立累犯。 (3)首先，因为甲在假释考验期内犯了新罪，所以应当撤销假释，依照先减后并的方法实行数罪并罚。即法院应当对甲新犯的罪做出判决，把甲前罪没有执行的刑罚(4年)和后罪所判处的刑罚，依照《中华人民共和国刑法》第六十九条的规定决定执行的刑罚。其次，由于甲构成累犯，根据《中华人民共和国刑法》第六十五条的规定，应当从重处罚。