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A
被子植物在我国药用植物中占 90%，占中药资源总数的 78.5%，是植物资源中非常重要的一类
B
恩格勒分类系统把单子叶植物排在双子叶植物前面，以此反映他对植物演化的认识
C
哈钦松分类系统把单子叶植物排在双子叶植物后面，以此反映他对植物演化的认识
D
克朗奎斯特系统认为菊亚纲是本纲中最进化的类群，这是他对植物演化问题的看法
正确答案 ：A
解析
A 【解析】细节理解题。A 项“被子植物在我国药用植物中占 90%，占中药资源总数的78.5%，是植物资源中非常重要的一类”是用人为的功能价值分类的，属于人为分类法。无法反映自然分类法思想，当选。B 项“恩格勒分类系统把单子叶植物排在双子叶植物前面，以此反映他对植物演化的认识”属于按照植物表面细微特征分类，属于自然分类法，排除；C 项“哈钦松分类系统把单子叶植物排在双子叶植物后面，以此反映他对植物演化的认识”依然是按照植物表面细微特征分类，出于自然分类法，排除；D 项“克朗奎斯特系统认为菊亚纲是本纲中最进化的类群，这是他对植物演化问题的看法”属于按照植物纲类进行的分类，属于自然分类法，排除。故本题答案为 A 项。
